为什么同一块胶,Marker 会影响你对分子量的判断?
本文主要介绍为什么蛋白分子量 Marker 的标准曲线会随凝胶浓度、缓冲体系而变化,以及如何正确用 Marker 估读目标条带分子量。
你以为 Marker 是「尺子」,量出来就准?
其实 Marker 给的是「在这块胶、这套条件下」的相对刻度。
换胶浓度、换缓冲体系,尺子就悄悄变了。
定义|什么是蛋白分子量 Marker?
蛋白分子量 Marker(预染/未染)是已知分子量的一组标准蛋白,与样品同跑 SDS-PAGE,用于根据迁移距离反推样品蛋白的近似分子量。 |
SDS-PAGE 中蛋白带均匀负电荷,迁移距离主要取决于分子量(对数关系)。
Marker 各条带已知分子量,连成标准曲线后,用样品条带的位置反查分子量。
注意:这是「近似」,不是精确测定。
| 变量 |
对分子量估读的影响 |
| 凝胶浓度 |
高浓度胶对小蛋白分辨好,但大蛋白迁移慢、估读易偏 |
| 缓冲体系 |
Tris-Glycine 与 Bis-Tris 体系迁移行为不同 |
| 蛋白修饰 |
糖基化/磷酸化改变实际迁移,出现「假分子量」 |
| 预染与否 |
预染 Marker 迁移略慢于未染,需校正 |
即使同一块胶,边缘效应(胶两端散热差)、加样量不均、Marker 与样品泳道离子强度差异,都会让标准曲线局部偏移。
所以跨胶比较分子量时误差更大,需用内参或平行 Marker 校正。
| # |
步骤说明 |
| 1 |
选与样品分子量范围匹配的凝胶浓度(如 10-12% 通用) |
| 2 |
样品与 Marker 同板同条件电泳 |
| 3 |
用成像软件拟合标准曲线再估读 |
| 4 |
跨实验比较时以内参条带位置做相对校正 |
| 误区 |
正确认知 |
| Marker 给的就是真实分子量 |
只是该条件下的近似估读,受胶浓度与修饰影响 |
| 预染和未染 Marker 等价 |
预染分子量略偏大,混用需校正 |
| 条带位置=精确质量数 |
精确质量需质谱,WB 仅半定量估读 |
| 实验方向 |
源叶相关品类 |
用途提示 |
| 蛋白 Marker |
宽范围预染蛋白分子量标准 |
覆盖常见 10-180 kDa 区间 |
| PAGE 试剂 |
不同浓度预制胶/配制试剂 |
按需匹配分子量范围 |
| 转膜配套 |
转膜缓冲液、PVDF/NC 膜 |
与 Marker 协同完成 WB |
| Q:Marker 为什么会影响分子量判断? |
| A:Marker 给出的是特定胶浓度与缓冲体系下的相对刻度,换条件标准曲线会变,估读随之偏移。 |
| Q:怎么用 Marker 估读才靠谱? |
| A:样品与 Marker 同板同条件跑,用软件拟合标准曲线,跨实验以内参校正。 |
| Q:预染和未染 Marker 能混用吗? |
| A:预染蛋白迁移略慢,混用会引入偏差,建议同次实验统一类型。 |
| Q:为什么糖基化蛋白分子量会估错? |
| A:糖链改变迁移行为,SDS-PAGE 估读会偏离真实质量,需用质谱确认。 |
| Q:凝胶浓度怎么选? |
| A:小蛋白用高浓度胶(如 15%),大蛋白用低浓度胶(如 8%),通用可选 10-12%。 |
| Q:WB 能给出精确分子量吗? |
| A:不能,WB 只能估读近似分子量;精确质量数需借助质谱。 |
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